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余珂

最高学历:博士

研究方向:生物能源

 办公室:E-204

 E-mail:yuke@pkusz.edu.cn

2014年博士毕业于香港大学;

2014年至2016年,加州大学伯克利分校博士后;

2016年7月至今为北京大学环能学院助理教授。

主要研究方向多组学联用技术开发,包括相应的生物信息学方法及分子生物学技术开发,并将其应用于解译污水处理系统中微生物互作关系,为调控环境工程体系中的微生物群落提供理论基础。到目前为止,共发表SCI论文36篇,其中以第一作者或通讯作者身份在Microbiome,Environmental Science & Technology,Analytica Chimica Acta 等环境领域顶级期刊上发表 SCI 论文 10余篇。第一作者或通讯作者文章中最高影响因子为11.6,平均影响因子为 6.281。研究成果已得到国际学术同行的广泛关注和高度认可,论文他引总数 2000 余次。其中单篇最高他引 200 余次,该论文被丹麦奥尔本大学(Aalborg University)的世界污水处理微生物的权威专家Per H Nielsen教授在2013年的“Microbial Ecology and Water Engineering Specialist Conference” (MEWE)上评为近50年来,解析活性污泥微生物生态的研究技术型论文中的12篇里程碑式论文之一。入职后主持包括国家自然科学基金在内的纵向课题两项,并作为协助单位第一负责人参与一项国家自然科学基金重点项目、一项国家自然科学基金面上及一项青年科学基金项目。兼任 ISME J, Environmental Science & Technology,Water Research等多个微生物生态、环境科学与技术国际专业期刊的审稿人。

主要研究方向为:
(1) 多组学联用技术开发(multi-meta-omics,宏基因组、宏转录组、宏代谢组)及新一代测序技术(Nanopore、PacBio测序)相关分析技术的开发:

a). 开发生物信息学算法;

b). 构建可视化平台(www.embl.pkusz.edu.cn或http://www.sys-omics.com/)
(2) 环境微生物环境修复技术。通过了解微生物群落结构、微生物间物质交换机制及参与降解的功能酶等调节微生物群落以达到环境修复的目;

(3)环境微生物资源发掘:关注极端环境条件(极地、极端盐湖)下的微生物类群及其微生物资源开发;

(4)肠道微生物调查:关注野生动物,包括小型哺乳类动物、鸟类,及人类肠道微生物种群及功能研究

代表论文:

  1. Ke Yu*#, Shan Yi#, Bing Li, Feng Guo, Xingxing Peng, Zhiping Wang, Yang Wu, Lisa Alvarez-Cohen and Tong Zhang*. An integrated meta-omics approach reveals substrates involved in synergistic interactions in a bisphenol A (BPA)- degrading microbial community. Microbiome. 2019, 7: 16. (第一兼通讯作者)
  2. Ray Keren#, Jennifer Lawrence#, Wei-Qin Zhuang, David Jenkins, Jillian F Banfield, Lisa Alvarez-Cohen, Lijie Zhou*, Ke Yu*. Increased replication of dissimilatory nitrate-reducing bacteria leads to decreased anammox bioreactor performance. Microbiome, 2020, 8: 7. (共同通讯作者)
  3. Chen Lianguo#, Yu Ke#, Huang Changjiang, Yu Liqin, Zhu Bingqing, Lam Paul K. S., Lam James C. W., Zhou Bingsheng*. Prenatal transfer of polybrominated diphenyl ethers (PBDEs) results in developmental neurotoxicity in zebrafish larvae. Environmental Science & Technology, 2012, 46, 9727-9734. (共同第一作者)
  4. Ke Yu, Bing Li, Tong Zhang*. Direct rapid analysis of multiple PPCPs in municipal wastewater using ultrahigh performance liquid chromatography- tandem mass spectrometry without SPE pre-concentration. Analytica Chimica Acta, 2012, 738, 59-68. (第一作者)
  5. Ke Yu, Tong Zhang*. Metagenomic and metatranscriptomic analysis of microbial community structure and gene expression of activated sludge. PLoS ONE, 2012, 7(5): e38183. (第一作者)

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